由于冷灌装后瓶不会收缩，这样物料和瓶盖之间会有-部分空气，其中的氧会在存放过程中缓慢氧化物料，从而导致饮料变质。所以，全玻璃瓶旋盖机设备会添加一套氮气(或其他惰性气体)置换系统，将顶部的空气吹走，保证物料不被氧化。

    无菌空间环境的保持，一般采用净化间隔离措施。主体旋盖机设计为D100级空气净化间，外面还有万级净化间(有些无菌灌装设备并不需要)，通过净化间的过滤系统保证灌装环境内空气洁净度，使物料不会被空气中悬浮的微生物二次污染。

    对于中性饮料无法用热灌装工艺进行生产，由于其采用倒瓶方式对瓶盖进行杀菌，高酸饮料还可以抑制微生物增长，而中性饮料则无法保证产品安全性，产品不良率很高。如果用热灌装工艺生产中性茶饮料，就必须添加防腐剂。对于全玻璃瓶旋盖机，由于是在无菌条件从两者工艺流程图对比来看，最大的区别就是饮料受热时间不同。众所周知，热处理时间越长，对饮料的品质和口感影响越大。全玻璃瓶旋盖机采用UHT超高温瞬时杀菌，对物料的热处理时间不超过30秒，并且在高温情况下完全可以保证杀菌效果，而热灌装采用的杀菌方式使物料长时间处在高温状态下，严重影响产品口感、色泽以及热敏性营养素(如维生素)含量。

    此外，从生产线配置上来看，当旋盖机出现故障停机肘，采用热灌装方式处理的物料有-部分回流会延长受热时间，这样会严重影响整批产品的质量，而全玻璃瓶旋盖机不会有此现象发生，物料经过瞬时杀菌后已经降到室温，置于无菌罐内不会影响其品质。

    所使用瓶的比较。从上面的灌装工艺可以看出，两种灌装方式对瓶的要求是不同的。热灌装工艺要求瓶能够承受85℃~92℃的高温且不变，这就要求增大材料的结晶度，同时在吹瓶时要限制诱导应力的产生。其使用的瓶就有以下特点：瓶壁厚，有明确的瓶壁肋骨防止热收缩；要求有结晶瓶口等，大大限制了瓶型设计的自由度。玻璃瓶旋盖机可以使用轻质瓶(最高耐热温度60℃)和标准盖，这样大大降低了瓶子和盖子的成本，还可以自由的选择设计瓶型。下进行灌装，其工艺适应性强，能够生产的产品类型非常广泛，包括中性茶饮品、乳饮料以及其他各种饮料，只需对前处理设备进行调整既可改变产品类型。